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Scipas DX (Single-Charged Ion Peak Analyzing System) ver 1.39
このソフトはMALDI−MSを使ったタンパク質H/D交換の解析を助けるものです。

H/D交換の解析は同位体ピークが複雑で解析が難しい。もしあなたがMALDI−MSを使ったタンパク質H/D交換を行うなら、このソフトは役に立ちます。

*"Scipas DX"はFreeです。配布はご遠慮ください。何かあったら下記のアドレスにメールを下さい .

Reference
Tatsuya Yamamoto, Tohru Yamagaki., Honoo Satake*.
“Development of Software for the In-Depth Analysis of Protein Dynamics as Determined by MALDI Mass Spectrometry-Based Hydrogen/Deuterium Exchange”
Mass Spectrom (Tokyo) , 8, S0082 (2019)

recent update:
2020.4.23 Graphical refinement. ver 1.39

"Download" ＊This software needs Java. Java Download ⇒ (English,Japanese)
ウィンドウ
このプログラムは４つのウィンドウからなります。: Spectrum main frame (SpectraManager), HD exchange result frame (HDX Manager), Sequence frame (Sequence Manager), and Profile frame of exchanged deouterium (Isotopic Imager).

four



使用方法

  1. sequence file (e.g. :"test_seq.prds")を sequence managerに読み込みます

    2. squence


  2. sequence managerにて解析するペプチドの最初と最後の残基を選びます。


  3. "add buttonadd"を押します。 するとHDX managerに新しいペプチドが追加されます。

    4. HDX


  4. spectra file (e.g. :"test_spec.spe")を spectra managerに読み込みます。

    5. graph


  5. analysis
    ボタンを押します。


  6. 終了です。

    7. *交換した重水素のプロファイルはIsotopic imagerで見ることができます。
    graph



    *save dataは3つのファイル(e.g. :"test.hdx", "test_spec.spe", "test_seq.prds")になります。
    *単一ペプチドのみ再計算することも可能です。graph

    *指定フォルダ内のスペクトルファイルを一斉解析することもできます。graph

    解析中は休憩をとるのも次の実験を行うのも自由です。

Up date log. (year.month.day)


Send me e-mail for Scipas DX to"mail".
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